arXiv · cs.AI· Maojiang Su, Jiale Chen, Qijie Zhu, Shang Wu, Jiayi Wang, Jihai Zhao, Guo Ye, Yibo Wen, Han Liu·· 18 小时前
PairFuse:将预训练全原子表示泛化到统一结合体设计
Towards Generalizing Pretrained All-Atom Representations to Unified Binder Design
AI 导读
PairFuse 通过轻量级逐层 adapter 将预训练全原子表示融入独立预训练的几何隐扩散模型,实现统一结合体设计。该方法以特征增强和成对结构信息注入两种机制改造扩散去噪器,理论上证明其保持几何性质并带来额外注意力表达力。在抗体、多肽和小分子结合体设计基准上,PairFuse 性能优于预训练扩散模型及现有表示融合基线。
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