arXiv · cs.LG· Xuantuo Huang, Encheng Su, Aoran Wang, Pan Tan, Shengyong Xu, Yizhou Wang, Chen Tang, Shixiang Tang, Mingxiao Li·· 2 小时前
ADT：面向3D分子结构的全原子扩散分词器
ADT: All-Atom Diffusion Tokenizer for 3D Molecular Structures
AI 导读
研究者提出全原子扩散分词器 ADT，将 token 粒度与重建分辨率解耦：小分子每个原子一个结构 token，蛋白质每个残基一个 token 并同时表示主链与侧链几何。ADT 借助扩散模型的生成能力，从紧凑离散 token 中恢复量化损失的精细原子几何。实验显示其在小分子和蛋白质上均实现高质量重建，并支持两类结构的自回归生成。
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